Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH6

TMLHE, Trimethyllysine dioxygenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHEQ9NVH6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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