Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms