Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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