Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms