Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRHQ9HD43 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms