Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms