Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPJQ9HC77 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms