Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLMPQ9H6B4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms