Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms