Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms