Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms