Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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FOXQ1Q9C009 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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