Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SMIM3Q9BZL3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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