Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRRTQ9BXP5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms