Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms