Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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