Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms