Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms