Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms