Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCC1Q96RQ3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms