Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms