Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms