Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ7

TM4SF19, Transmembrane 4 L6 family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF19Q96DZ7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF19Q96DZ7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms