Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUB2Q96DC9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTUB2Q96DC9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTUB2Q96DC9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTUB2Q96DC9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTUB2Q96DC9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTUB2Q96DC9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTUB2Q96DC9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTUB2Q96DC9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTUB2Q96DC9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTUB2Q96DC9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTUB2Q96DC9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUB2Q96DC9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms