Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms