Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEIL2Q969S2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEIL2Q969S2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms