Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKD1Q969G9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms