Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEO1Q92859 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEO1Q92859 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms