Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTTNBP2Q8WZ74 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CTTNBP2Q8WZ74 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CTTNBP2Q8WZ74 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTTNBP2Q8WZ74 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTTNBP2Q8WZ74 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTTNBP2Q8WZ74 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTTNBP2Q8WZ74 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTTNBP2Q8WZ74 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTTNBP2Q8WZ74 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTTNBP2Q8WZ74 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CTTNBP2Q8WZ74 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CTTNBP2Q8WZ74 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTTNBP2Q8WZ74 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTTNBP2Q8WZ74 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CTTNBP2Q8WZ74 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CTTNBP2Q8WZ74 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms