Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms