Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms