Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms