Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAVCR2Q8TDQ0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms