Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 TAF5L-204ENST00000366676 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 KLF17-201ENST00000372299 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 PIGG-201ENST00000310340 3203 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 PIGG-203ENST00000453061 3218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 TREH-201ENST00000264029 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 UGT1A10-202ENST00000373445 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 FGFR2-203ENST00000351936 2478 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 NLRP10-201ENST00000328600 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 SLC7A3-202ENST00000374299 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 SNAP25-202ENST00000304886 2050 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 IKZF4-203ENST00000547167 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms