Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms