Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms