Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms