Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37DQ86XT2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms