Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRP13Q86W25 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRP13Q86W25 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRP13Q86W25 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRP13Q86W25 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms