Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms