Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms