Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT07

TBC1D9, TBC1 domain family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D9Q6ZT07 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBC1D9Q6ZT07 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBC1D9Q6ZT07 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms