Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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C9orf47Q6ZRZ4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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