Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms