Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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