Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms