Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms