Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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FAM208BQ5VWN6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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FAM208BQ5VWN6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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FAM208BQ5VWN6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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FAM208BQ5VWN6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM208BQ5VWN6 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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