Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms