Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM164Q5U3C3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms